Tout comme la Mustang, Shelby 1968 subit des transformation par rapport au modèle 1967. C’est en 1968 que le nom Cobra est rattaché a la marque de commerce. Les voitures sont maintenant reconnues sous le nom de Shelby Cobra GT350 et Shelby Cobra GT500. La plus grande nouveauté pour 1968 est l’introduction de la version convertible de la Shelby. Les Shelbys étaient offertes avec les moteurs 302-4V pour le GT350 et 427-4V ou 428-4V pour les GT500 . Quand le moteur 427 a été abandonné de la liste de Mustang, le moteur 428 Cobra Jet l’a remplacé sur la GT500. Le nouveau moteur 428 Cobra Jet a amené la création d’un nouveau modèle: la GT500KR. KR pour “King of the Road”. Les scoops sur le capot prennent de l’ampleur, à vrai dire, presque la totalité du capot. Les feux arrières ont été empruntés sur la Thunderbird 1965 avec les indicateurs séquentiels. À l’intérieur, on y retrouve les couvre-siège de luxe de la Mustang et un tableau de bord tout instrumenté incluant un tachymètre allant jusqu’à 8000 tr/min et un indicateur de vitesse allant jusqu’à 140 mph. La console centrale est marquée par un Cobra. En tout, 4 450 Shelby Cobra 1968 ont été construites. 1 253 GT350 Fastbacks, 404 GT350 Convertibles, 1140 GT500 Fastbacks, 402 GT500 Convertibles, 933 GT500KR Fastbacks et 318 GT500KR Convertibles